對於要繪製的對象，先平移再將之旋轉，與先旋轉將再之平移，結果是不同的：
因此，為了要能達到想要的轉換結果，就要留意轉換操作的順序，例如，在〈轉換矩陣〉中最後的範例，想要看到方塊逆時針轉動，必須先平移方塊，再將方塊繞著 Z 軸轉動，範例的程式片段是這麼撰寫的：
...
transformation = mat4.translate(transformation, 0.25, 0, 0); // 先平移
let i = 0;
function drawCube() {
i++;
renderer.uniformMatrix4fv('transformation',
mat4.zRotate(transformation, 0.025 * i) // 再旋轉
);
...
}
不過，程式碼可以使用這樣的順序來撰寫，是因為 translate、scale、xRotate、yRotate、zRotate 是這麼撰寫的：
translate(m, tx, ty, tz) {
return this.multiply(this.translation(tx, ty, tz), m);
},
scale(m, sx, sy, sz) {
return this.multiply(this.scaling(sx, sy, sz), m);
},
xRotate(m, radians) {
return this.multiply(this.xRotation(radians), m);
},
yRotate(m, radians) {
return this.multiply(this.yRotation(radians), m);
},
zRotate: function(m, radians) {
return this.multiply(this.zRotation(radians), m);
}
也就是，對於一個舊有的轉換矩陣 m，想要進行轉換操作時，是將下一個轉換操作矩陣乘上 m，這種寫法稱為前乘（Pre-Multiplication）或左乘（Left-Multiplication），也就是下個轉換操作矩陣在前，或者說是左邊。
這麼做的話，如果程式碼撰寫時是 translate 後 zRotate，就會如上頭的說明的方式進行，然而，前乘並不是 OpenGL 的慣例，因為 WebGL 衍生自 OpenGL，WebGL 的矩陣處理程式庫，實際上也不會是採取前乘的方式。
WebGL 的矩陣處理程式庫，慣例上會依循 OpenGL，也就是採用後乘（Post-Multiplication）或右乘（Right-Multiplication），也就是對於一個舊有的轉換矩陣 m，想要進行轉換操作時，是將下一個轉換操作矩陣會是放在後面，或者說是右邊。
由於矩陣乘法具有結合律，就數學公式本身的演算來說，例如 S * R * T * V，前乘或後乘，不過是從後面往前算，或者是從前面往後算，結果都是相同的。
只不過，撰寫程式碼時總究需要個前後順序，而採用前乘時，操作頂點的順序正好符合程式碼上呼叫函式的順序，如〈轉換矩陣〉中的範例就是如此。
然而，如果打算採用後乘的慣例，translate、scale、xRotate、yRotate、zRotate 就必須改寫為：
translate(m, tx, ty, tz) {
return this.multiply(m, this.translation(tx, ty, tz));
},
scale(m, sx, sy, sz) {
return this.multiply(m, this.scaling(sx, sy, sz));
},
xRotate(m, radians) {
return this.multiply(m, this.xRotation(radians));
},
yRotate(m, radians) {
return this.multiply(m, this.yRotation(radians));
},
zRotate: function(m, radians) {
return this.multiply(m, this.zRotation(radians));
}
然而，這會造成一個結果，操作頂點的順序與程式碼撰寫上的順序是反過來的，例如想要完成同樣是逆時針轉動的話，就必須寫為：
let zRotation = mat4.create();
function drawCube() {
zRotation = mat4.zRotate(zRotation, 0.025);
let transformation = mat4.translate(zRotation, 0.25, 0, 0);
transformation = mat4.xRotate(transformation, 0.5);
transformation = mat4.yRotate(transformation, 0.5);
renderer.uniformMatrix4fv('transformation', transformation);
renderer.clear();
renderer.bindBuffer(GL.ARRAY_BUFFER, vertBuffer);
renderer.bufferSubData(GL.ARRAY_BUFFER, 0, geometry.verteices);
renderer.render(cube);
requestAnimationFrame(drawCube);
}
可以點選完整的範例網頁來看看結果，乍看之下撰寫程式碼時，順序似乎很不直覺，其實這是觀點不同，這時在建立轉換矩陣的過程，心智模型應想著數學公式上的右乘順序，不是頂點操作順序，也就是說，心裡想的要是 Rz * T * Rx * Ry，而程式碼的順序對照的是由左至右的順序。
（某些程度上，感覺這就像是函數式設計，畢竟 3D 運算就是數學，你要想著這邊要完成一個什麼轉換矩陣，而不是如何對頂點做操作，也就是函數式設計上常說的，宣告 What，而不是編寫 How。）
當然，若你堅持前乘而不是後乘，也不能說錯，只不過不符合 OpenGL/WebGL 的慣例下，在必須與其他工具或程式庫結合時，而它們採用的是後乘的慣例，會遇上些困擾就是了。